В Zero Divide вы играете за смотрителя компьютера, который должен отбиться от членов группировки XTAL и вывести систему из строя до того, как истечет время и важная информация просочится в мир. Вам предстоит сразиться с десятью бойцами и двумя скрытыми боссами, используя различные приемы, такие как гиперудар головой, удар вслепую, вихревой бросок Томо и "Кровавая стая". Наблюдайте за происходящим с помощью четырех камер с возможностью поворота на 360 градусов. Экранная диаграмма информирует вас о повреждениях вашего персонажа и позволяет спланировать стратегию следующей атаки.

Быстро развивающаяся игра-головоломка, в которой игрок уничтожает цветные фигуры, приближающиеся к его альтер-эго, другой цветной фигуре, прежде чем они достигнут вершины, как в Тетрисе. Чтобы уничтожить другие фигуры, вы должны навести на нее свою фишку и "выстрелить". Если фигура того же цвета, что и ваша фигура, то она удаляется, а также все фигуры того же цвета за ней, пока ваша фигура не столкнется с фигурой другого цвета. Если фигура другого цвета или она попала в линию из похожих фигур, ваша фигура поменяется цветами с фигурой.